RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.48■□□□□ 0.07
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC6A18Q96N87 628 aa15.48■□□□□ 0.07
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPMTP51580 245 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAS2R41P59536 307 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DOC2BQ14184 412 aa15.46■□□□□ 0.07
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAM2Q15035 370 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSX1Q16384 188 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALG11Q2TAA5 492 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM16LQ309B1 348 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MFSD12Q6NUT3 480 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.46■□□□□ 0.07
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