RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527333.5

CKAP5-208, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene CKAP5, Length 498 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-208ENST00000527333 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SMIM18P0DKX4 95 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 DCTP40126 519 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MAGEA8P43361 318 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MAN2A2P49641 1150 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 LIM2P55344 173 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 BTN3A2P78410 334 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 HSD11B2P80365 405 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 VLDLRP98155 873 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 PPP2R2BQ00005 443 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MYBPC1Q00872 1141 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SPIDRQ14159 915 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 NRF1Q16656 503 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SLC36A3Q495N2 470 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 GALNT10Q86SR1 603 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 RNF130Q86XS8 419 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 FAM162AQ96A26 154 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 EME1Q96AY2 570 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 GIMAP5Q96F15 307 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SERINC2Q96SA4 455 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 PDE7BQ9NP56 450 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 DAPP1Q9UN19 280 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.49□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 M0QX08 132 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 HMGN4O00479 90 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 TXNDC9O14530 226 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SLC30A4O14863 429 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 FOXS1O43638 330 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ALPLP05186 524 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 IMPDH2P12268 514 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ALOX12P18054 663 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CD247P20963 164 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CCKBRP32239 447 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 HSPA13P48723 471 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 IST1P53990 364 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CASP9P55211 416 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CDK6Q00534 326 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 TNFRSF17Q02223 184 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 RGS1Q08116 209 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MGAT2Q10469 447 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 FUT5Q11128 374 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 MED21Q13503 144 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 PDK3Q15120 406 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 FHL5Q5TD97 284 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 DEFB124Q8NES8 71 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SFXN5Q8TD22 340 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 BDH2Q9BUT1 245 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 NLNQ9BYT8 704 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 LYRM4Q9HD34 91 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.48□□□□□ -1.05
CKAP5-208ENST00000527333 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms