RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445706.5

PACSIN2-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2, human

TSL 5

Gene PACSIN2, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN2-208	ENST00000445706	GPR180	Q86V85	440 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CALML6	Q8TD86	181 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ANKRD7	Q92527	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	OMA1	Q96E52	524 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	OR10A5	Q9H207	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	GLOD5	A6NK44	160 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	TGFA	P01135	160 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PYGB	P11216	843 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CREB1	P16220	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	IL11	P20809	199 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ADH6	P28332	368 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC6A8	P48029	635 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CLDN20	P56880	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	GGTLC2	Q14390	218 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SPA17	Q15506	151 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	MIDN	Q504T8	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	VSTM4	Q8IW00	320 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SERPINB12	Q96P63	405 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	EGFL8	Q99944	293 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	EHD1	Q9H4M9	534 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	NGB	Q9NPG2	151 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	FANCF	Q9NPI8	374 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PHF11	Q9UIL8	331 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	MAGEB16	A2A368	324 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC35E2	P0CK97	266 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	FCGR2A	P12318	317 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	HNMT	P50135	292 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CDH11	P55287	796 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CTBP2	P56545	445 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CDKL1	Q00532	357 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	IRF9	Q00978	393 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	RAB35	Q15286	201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	C4orf22	Q6V702	233 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CNGA4	Q8IV77	575 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	FAM157A	C9JC47	383 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	LY6H	O94772	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	MBD3	O95983	291 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	TGFB1	P01137	390 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CSF3	P09919	207 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCDC175	P0C221	793 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	KAT2A	Q92830	837 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	WDR34	Q96EX3	536 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PACSIN2-208	ENST00000445706	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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