RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	WISP1	O95388	367 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CT45A8	P0DMV1	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CT45A9	P0DMV2	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	LAMP1	P11279	417 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GPC1	P35052	558 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PRR5	P85299	388 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ACAD11	Q709F0	780 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241		E9PBE3	544 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PTGER1	P34995	402 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MEOX1	P50221	254 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SNTA1	Q13424	505 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35A4	Q96G79	324 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241		Q9N2J8	555 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	UBD	O15205	165 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SNX4	O95219	450 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CBX6	O95503	412 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	KRT16	P08779	473 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF24	P17028	368 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	MAP3K8	P41279	467 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	PSG6	Q00889	435 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	EFR3A	Q14156	821 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	NUP43	Q8NFH3	380 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR2M7	Q8NG81	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	OMA1	Q96E52	524 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB18	Q99592	522 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPA-222	ENST00000445241	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC13	O75165	2243 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ACOT7	O00154	380 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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