RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NRN1Q9NPD7 142 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFP57Q9NU63 452 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 EMCNQ9ULC0 261 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 AFF2P51816 1311 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A0J9YVX5 310 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM74A7A6NL05 159 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CASKO14936 926 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DUX1O43812 170 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RHBDL1O75783 438 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRYAAP02489 173 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADORA3P0DMS8 318 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANXA3P12429 323 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NCK1P16333 377 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 AMD1P17707 334 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TPSB2P20231 275 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NT5EP21589 574 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR183P32249 361 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAGEA5P43359 124 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FGL1Q08830 312 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ENPP2Q13822 863 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MTF1Q14872 753 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TPSAB1Q15661 275 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM228AQ86W67 206 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRRC43Q8N309 656 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR6S1Q8NH40 331 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NANPQ8TBE9 248 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 AGR3Q8TD06 166 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 NR4A3Q92570 626 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAPNS2Q96L46 248 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PINK1Q9BXM7 581 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC7Q96M83 1385 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1B0GUV1 79 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ESYT2A0FGR8 921 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 K7ERI5 159 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 EI24O14681 340 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF264O43296 627 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 EFNA2O43921 213 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ECI2O75521 394 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLPTM1O96005 669 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ASGR1P07306 291 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD48P09326 243 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SELEP16581 610 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSMA2P25787 234 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLA2G16P53816 162 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRRX1P54821 245 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 PAX9P55771 341 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 OSTNP61366 133 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 BST1Q10588 318 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 GCKRQ14397 625 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM189A2Q15884 450 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 SYPL1Q16563 259 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 HAGHQ16775 308 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 UNC50Q53HI1 259 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 HOGA1Q86XE5 327 aa3.53□□□□□ -1.84
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTC5Q8N0Z6 440 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms