RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 DPTQ07507 201 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 POU4F2Q12837 409 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DECR1Q16698 335 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 EIPR1Q53HC9 387 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SPERTQ8NA61 448 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF11Q92914 225 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RNFT2Q96EX2 444 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR137Q96N19 417 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC6A18Q96N87 628 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF558Q96NG5 402 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZIC5Q96T25 663 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MED28Q9H204 178 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 DUX4Q9UBX2 424 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 GLS2Q9UI32 602 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0U1RQS6 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PQ72 361 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MU76 341 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF749O43361 778 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 OR5F1O95221 314 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 GNRH1P01148 92 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRNPP04156 253 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 KLK1P06870 262 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TYRP14679 529 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 UGT2B7P16662 529 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LAG3P18627 525 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NPR2P20594 1047 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 ETV5P41161 510 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-202ENST00000586851 ETV1P50549 477 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CCR8P51685 355 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CDH11P55287 796 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ABATP80404 500 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 REEP5Q00765 189 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TGM3Q08188 693 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DYRK1AQ13627 763 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 BTBD16Q32M84 506 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC58Q4VC31 144 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.29□□□□□ -1.24
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