RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	TAGAP	Q8N103	731 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	MGARP	Q8TDB4	240 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	C1orf50	Q9BV19	199 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	WIPF3	A6NGB9	483 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRTM2	O43300	516 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PLOD3	O60568	738 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCD3	P28288	659 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	NTS	P30990	170 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	MPI	P34949	423 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	MC3R	P41968	323 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	CORO7	P57737	925 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PLGLB1	Q02325	96 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	BST1	Q10588	318 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	STX3	Q13277	289 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE7A	Q13946	482 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM107	Q6UX40	140 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	GK5	Q6ZS86	529 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	FJX1	Q86VR8	437 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	LIX1	Q8N485	282 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	REEP4	Q9H6H4	257 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TPCN1-223	ENST00000552985	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	FRG2C	A6NGY1	282 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	UPK1A	O00322	258 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	PDPK1	O15530	556 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC19A2	O60779	497 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	TBX19	O60806	448 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE9A	O76083	593 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	CELA3A	P09093	270 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	CT45A8	P0DMV1	189 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	CT45A9	P0DMV2	189 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	DRD5	P21918	477 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	GRK2	P25098	689 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	PPIC	P45877	212 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	NRG3	P56975	720 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	PTGR1	Q14914	329 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS6KA2	Q15349	733 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	C3AR1	Q16581	482 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	IL23R	Q5VWK5	629 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	GHDC	Q8N2G8	530 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	RELT	Q969Z4	430 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	OMA1	Q96E52	524 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76

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