RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 PIP5K1BO14986 540 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 LSM1O15116 133 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 PTGS2P35354 604 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CASP6P55212 293 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 KCNJ2P63252 427 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 SH2D4BQ5SQS7 431 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CEP85LQ5SZL2 805 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 RGS9BPQ6ZS82 235 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 FAM109AQ8N4B1 249 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 FAM57AQ8TBR7 257 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 SPPL2AQ8TCT8 520 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 NTNG2Q96CW9 530 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 GIMAP4Q9NUV9 329 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 GIMAP2Q9UG22 337 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 TEX15Q9BXT5 2789 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 RGS14O43566 566 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 IGHG3P01860 377 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 NEFHP12036 1026 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 SDC1P18827 310 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 SERPINB4P48594 390 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 EMC4Q5J8M3 183 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 NPSR1Q6W5P4 371 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 IKBIPQ70UQ0 350 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CD163Q86VB7 1156 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 FAM9CQ8IZT9 166 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CLYBLQ8N0X4 340 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 DIO2Q92813 273 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ERP27Q96DN0 273 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 VSTM2LQ96N03 204 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 BBS4Q96RK4 519 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 DMRTA2Q96SC8 542 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ZFP64Q9NPA5 681 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CFL2Q9Y281 166 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ANKRD33BA6NCL7 494 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CTIFO43310 598 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 PLOD3O60568 738 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 PPM1BO75688 479 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ATP6AP2O75787 350 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 JUNP05412 331 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 TUBBP07437 444 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 PPICP45877 212 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 NRG3P56975 720 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CORO7P57737 925 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 RPL38P63173 70 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CDSNQ15517 529 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ZNF385BQ569K4 471 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 XKR7Q5GH72 579 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 FNDC7Q5VTL7 733 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 TRILQ7L0X0 811 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 DDIASQ8IXT1 998 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 HGDQ93099 445 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 OMA1Q96E52 524 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 C3orf30Q96M34 536 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 AMDHD1Q96NU7 426 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 BTBD9Q96Q07 612 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 CCT7Q99832 543 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 DOHHQ9BU89 302 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 GLIPR2Q9H4G4 154 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 MIEF1Q9NQG6 463 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 PRODH2Q9UF12 536 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GVC2 190 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 WDR91A4D1P6 747 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 FRG2CA6NGY1 282 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 CAPN14A8MX76 684 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 PRRG2O14669 202 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 TO15178 435 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 ACOX3O15254 700 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 ITM2AO43736 263 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 CHEK2O96017 543 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 TPOP07202 933 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 DHRS4L1P0CG22 281 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 CT45A8P0DMV1 189 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 CT45A9P0DMV2 189 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 DRD5P21918 477 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-222ENST00000550996 MPIP34949 423 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms