RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 BOLA3Q53S33 107 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 MDH1BQ5I0G3 518 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 RAPH1Q70E73 1250 aa3.91□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa3.91□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 Q8NBF4 154 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 KCTD6Q8NC69 237 aa3.91□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 DTX3LQ8TDB6 740 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ZWILCHQ9H900 591 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 VPS28Q9UK41 221 aa3.91□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 MEI4A8MW99 385 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 TMEM114B3SHH9 223 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 H7C0C1 242 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 M0QYV0 167 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CYB561D2O14569 222 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 TO15178 435 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 PGAM1P18669 254 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 APOFQ13790 326 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 SFT2D3Q587I9 215 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 NAT14Q8WUY8 206 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 IRGQQ8WZA9 623 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CMTM5Q96DZ9 223 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 SPATA13Q96N96 652 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 KCNK16Q96T55 309 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 EBF4Q9BQW3 602 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 NAT9Q9BTE0 207 aa3.9□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.9□□□□□ -1.79
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