RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 MST1P26927 711 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 NTSP30990 170 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ZNF385BQ569K4 471 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 OGFOD2Q6N063 350 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 SIAH3Q8IW03 269 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 OR2L13Q8N349 312 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 LIX1Q8N485 282 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 SIMC1Q8NDZ2 872 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 OR7G2Q8NG99 324 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 OR52R1Q8NGF1 315 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 KAT2AQ92830 837 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PPCDCQ96CD2 204 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 VSTM2LQ96N03 204 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 TAS2R9Q9NYW1 312 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 TP53I11O14683 189 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 AKAP10O43572 662 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CT45A8P0DMV1 189 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CT45A9P0DMV2 189 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 G6PDP11413 515 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 LBPP18428 481 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 MEOX1P50221 254 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 NRG3P56975 720 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PPP2R2AP63151 447 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 FOXO1Q12778 655 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CAMKMTQ7Z624 323 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 OR2M7Q8NG81 312 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 C7orf26Q96N11 449 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 BTBD9Q96Q07 612 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 GAL3ST4Q96RP7 486 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ITPAQ9BY32 194 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PROK2Q9HC23 129 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 DEPPQ9NTK1 212 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 DTX4Q9Y2E6 619 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 FRG2CA6NGY1 282 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 UPK1AO00322 258 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 SDHDO14521 159 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ZNF195O14628 629 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ANKRD28O15084 1053 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PDPK1O15530 556 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ASNA1O43681 348 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 COQ9O75208 318 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PPM1BO75688 479 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 LRATO95237 230 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 P04436 131 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CCL3P10147 92 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 LAMP1P11279 417 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ABCD3P28288 659 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PTGER1P34995 402 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 HPCAL1P37235 193 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 MAP3K8P41279 467 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 MANFP55145 182 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PMP22Q01453 160 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 PTGR1Q14914 329 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 TBCELQ5QJ74 424 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CPTPQ5TA50 214 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-206ENST00000462743 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms