RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 AGAP5A6NIR3 686 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRKD3O94806 890 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ASMTP46597 345 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 MAPK12P53778 367 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SETD9Q8NE22 299 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PROX1Q92786 737 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 LGALS12Q96DT0 336 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PDE7BQ9NP56 450 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ADAM29Q9UKF5 820 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 GABRR3A8MPY1 467 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PTGES3LE9PB15 166 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ITGAMP11215 1152 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 OR4D2P58180 307 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 C2orf80Q0P641 193 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ZNF544Q6NX49 715 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SHISA5Q8N114 240 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SMIM10Q96HG1 83 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 CCDC115Q96NT0 180 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SNX4O95219 450 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 LAMP1P11279 417 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 COX7A2P14406 83 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PIGAP37287 484 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 C21orf58P58505 322 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 GNG2P59768 71 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 BTN3A2P78410 334 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ZNF404Q494X3 552 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 DEFB134Q4QY38 66 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ZNF385BQ569K4 471 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 DESI1Q6ICB0 168 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 UCN3Q969E3 161 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 QRFPRQ96P65 431 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SCN2AQ99250 2005 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 EDEM2Q9BV94 578 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 GORASP2Q9H8Y8 452 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRMT3O60678 531 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 DNAJB6O75190 326 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 CD59P13987 128 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 GGT1P19440 569 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRKCDQ05655 676 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SQSTM1Q13501 440 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SIGIRRQ6IA17 410 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 OR52E6Q96RD3 313 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 AGRPO00253 132 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 MED26O95402 600 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 IL6P05231 212 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 S100A3P33764 101 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SLAMF1Q13291 335 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD46Q86W74 232 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 IL17RDQ8NFM7 739 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 OR52E4Q8NGH9 312 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 OR5K1Q8NHB7 308 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 TRIM63Q969Q1 353 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 REEP4Q9H6H4 257 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 FLRT2O43155 660 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 FURINP09958 794 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 PRKCAP17252 672 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 IL1RNP18510 177 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 WNT3P56703 355 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 DEFA1P59665 94 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 DEFA3P59666 94 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 SLC35A2P78381 396 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 HSD11B2P80365 405 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU1-201ENST00000421832 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms