RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621665.1

GRAMD4P3-201, Transcript of GRAM domain containing 4 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene GRAMD4P3, Length 1,669 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZIM3Q96PE6 472 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LRRK2Q5S007 2527 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SNX4O95219 450 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CLPSP04118 112 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 IFI6P09912 130 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DRD5P21918 477 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ETV4P43268 484 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PPICP45877 212 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SERPINB4P48594 390 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FJX1Q86VR8 437 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MECRQ9BV79 373 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.9□□□□□ -0.02
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SVILO95425 2214 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCL21O00585 134 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HS6ST1O60243 411 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PLOD3O60568 738 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 S1PR1P21453 382 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GPX3P22352 226 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KRT20P35900 424 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MGAT2Q10469 447 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KIAA0040Q15053 153 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TMEM198Q66K66 360 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LYPD8Q6UX82 237 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MMP21Q8N119 569 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NATD1Q8N6N6 113 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DOK4Q8TEW6 326 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MTERF3Q96E29 417 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 A0A087WV62 115 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 A0A1W2PS29 197 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OR14I1A6ND48 311 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HSPA4LO95757 839 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SERPINE1P05121 402 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CHRNGP07510 517 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LINC00032P0C843 101 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCL3P10147 92 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PTGS2P35354 604 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SMSP52788 366 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DIO2Q92813 273 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FCRL1Q96LA6 429 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DOHHQ9BU89 302 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DEPPQ9NTK1 212 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FRG2CA6NGY1 282 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TTC36A6NLP5 189 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TBX19O60806 448 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ABCD3P28288 659 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SLC10A1Q14973 349 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 Q6ZSR9 355 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PACS2Q86VP3 889 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF597Q96LX8 424 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 REEP4Q9H6H4 257 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms