RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 A0A0G2JMM0 328 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PPB8 328 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PRS3 328 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CAPN14A8MX76 684 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNHIT1O43257 154 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SLC19A2O60779 497 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PEX11AO75192 247 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ATP6AP2O75787 350 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 HSPA4LO95757 839 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LDLRP01130 860 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SDC1P18827 310 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DNASE1L1P49184 302 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 EMDP50402 254 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NRG3P56975 720 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 HSF1Q00613 529 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PLGLB1Q02325 96 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GALNTL6Q49A17 601 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FJX1Q86VR8 437 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GHDCQ8N2G8 530 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FAM13CQ8NE31 585 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF675Q8TD23 568 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RELTQ969Z4 430 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C3orf30Q96M34 536 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TSSK3Q96PN8 268 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ITPAQ9BY32 194 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PROK2Q9HC23 129 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CNIH4Q9P003 139 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PRODH2Q9UF12 536 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SPTA1P02549 2419 aa8.43□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GTH9 108 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FAM166BA8MTA8 275 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TMEM114B3SHH9 223 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ACOT7O00154 380 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TP53I11O14683 189 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 AKAP10O43572 662 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PLOD3O60568 738 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PDE9AO76083 593 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LRATO95237 230 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SERPINE1P05121 402 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BGNP21810 368 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DRD5P21918 477 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ABCD3P28288 659 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CA7P43166 264 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PPICP45877 212 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SLC1A6P48664 564 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FBXW4P57775 412 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DCAF7P61962 342 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FOXO1Q12778 655 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 STX3Q13277 289 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NNATQ16517 81 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C3AR1Q16581 482 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 XKR7Q5GH72 579 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GK5Q6ZS86 529 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PRR22Q8IZ63 422 aa8.42□□□□□ -1.06
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