RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASB15Q8WXK1 588 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCMH1Q96GD3 660 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C5orf34Q96MH7 638 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AIG1Q9NVV5 245 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HPF1Q9NWY4 346 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC36A6NLP5 189 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACOX3O15254 700 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A12O75746 678 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IDO1P14902 403 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPX3P22352 226 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EMDP50402 254 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF385BQ569K4 471 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF766Q5HY98 468 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FHL5Q5TD97 284 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPGNQ6UW88 154 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAVSQ7Z434 540 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF605Q86T29 641 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2L13Q8N349 312 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TESCQ96BS2 214 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELP4Q96EB1 424 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPY30Q9C005 99 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPN3Q9H201 632 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PRB8 838 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRG2CA6NGY1 282 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD28O15084 1053 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC28A2O43868 658 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIAPH2O60879 1101 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMG1O95456 288 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F10P00742 488 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SP1P08047 785 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAGAP17050 411 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DRD5P21918 477 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPC1P35052 558 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MC3RP41968 323 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPICP45877 212 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSTA3Q16772 222 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NXNQ6DKJ4 435 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPINK14Q6IE38 97 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTL4Q6ZR62 310 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR7G2Q8NG99 324 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DOK4Q8TEW6 326 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KAT2AQ92830 837 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTBD9Q96Q07 612 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NTMQ9P121 344 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BSNQ9UPA5 3926 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UPK1AO00322 258 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TO15178 435 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBDO15205 165 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NME2P1O60361 137 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6B1O95007 311 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO45P0C2W1 286 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMP1P11279 417 aa14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms