RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRT14P02533 472 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGFBP5P24593 272 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 DPP4P27487 766 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERPINB3P29508 390 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SSR2P43308 183 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNC1P48547 511 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLDN20P56880 219 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLIN5Q00G26 463 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 MGAT2Q10469 447 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 LTB4RQ15722 352 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PALM2Q8IXS6 379 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC15A4Q8N697 577 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF611Q8N823 705 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAT8LQ8N9F0 302 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXT2Q93063 718 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 OMA1Q96E52 524 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR34Q96EX3 536 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 MS4A14Q96JA4 679 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNC2Q96PR1 638 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 TM9SF2Q99805 663 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSGA10Q9BZW7 698 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIGMQ9H3S5 423 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 NT5DC2Q9H857 520 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 L2HGDHQ9H9P8 463 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAB39LQ9H9S4 337 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CXorf21Q9HAI6 301 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 FETUBQ9UGM5 382 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 LIPT1Q9Y234 373 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 OARD1Q9Y530 152 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASB4Q9Y574 426 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0A6YYD5 115 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC22A20A6NK97 555 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 C16orf97H3BN30 126 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLGNO14967 610 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEC14L5O43304 696 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAMP1O60894 148 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPM1BO75688 479 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 LY6HO94772 140 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX4O95219 450 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CBX7O95931 251 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACTL6AO96019 429 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCNAP12004 261 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 COX7A2P14406 83 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 GNAZP19086 355 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 EDNRAP25101 427 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 BSGP35613 385 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIK3CGP48736 1102 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAS1P54826 345 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 DIO3P55073 304 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDK16Q00536 496 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHIT1Q13231 466 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SETDB1Q15047 1291 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 TGFBIQ15582 683 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP1B1Q16678 543 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 PACS2Q86VP3 889 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFNEQ86WN2 208 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX31Q8N9S9 440 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 MCUQ8NE86 351 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADCY4Q8NFM4 1077 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIT1Q92963 219 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CERS2Q96G23 380 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFAP36Q96G28 342 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 ART5Q96L15 291 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms