RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 CES4AQ5XG92 561 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ARL5BQ96KC2 179 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CHRNB2P17787 502 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GPX6P59796 221 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GABARAPL2P60520 117 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GRM2Q14416 872 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SORL1Q92673 2214 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SOCS2O14508 198 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MC3RP41968 323 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 THBS3P49746 956 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PRPS1P60891 318 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 FRS2Q8WU20 508 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MYADMQ96S97 322 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OARD1Q9Y530 152 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ATE1O95260 518 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PLATP00750 562 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 LILRB2Q8N423 598 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SNAPC3Q92966 411 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CD244Q9BZW8 370 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CUTCQ9NTM9 273 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 A8MXE2 369 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 FAM189A1O60320 539 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CBLP22681 906 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TXNDC15Q96J42 360 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SLC35F4A4IF30 521 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR6C6A6NF89 314 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 DEFB134Q4QY38 66 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR8K3Q8NH51 312 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF2O60811 474 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ADH7P40394 386 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MCHR1Q99705 422 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 EBF2Q9HAK2 575 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ACBD4Q8NC06 268 aa8.92□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SERPINE2P07093 398 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MAGEA6P43360 314 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 AGAP6Q5VW22 663 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 AGAP4Q96P64 663 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OPN1SWP03999 348 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CKMT2P17540 419 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TMEM110Q86TL2 294 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR51A7Q8NH64 312 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 OR4K3Q96R72 315 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 A0A096LPI6 279 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 HMX3A6NHT5 357 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 POU3F4P49335 361 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 PPA1Q15181 289 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 NADK2Q4G0N4 442 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SCLYQ96I15 445 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GINS1Q14691 196 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 SGTBQ96EQ0 304 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 C7orf34Q96L11 122 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GNG13Q9P2W3 67 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ADGRB2O60241 1585 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GLOD5A6NK44 160 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 J3QRK9 145 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 BMP4P12644 408 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 HTR1EP28566 365 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 GCH1P30793 250 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 MLLT10P55197 1068 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 RHDQ02161 417 aa8.91□□□□□ -0.98
CUX1-201ENST00000292535 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms