RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 CREB1P16220 341 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 TMED10P49755 219 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 FAM111BQ6SJ93 734 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 NUDCD3Q8IVD9 361 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CCDC116Q8IYX3 515 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CLYBLQ8N0X4 340 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ADCY4Q8NFM4 1077 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 OR2M7Q8NG81 312 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZIM3Q96PE6 472 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 BBS4Q96RK4 519 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 LRTM1Q9HBL6 345 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 C1orf109Q9NX04 203 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 MAT2BQ9NZL9 334 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 EHD3Q9NZN3 535 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa24.88■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 G3V3Y1 287 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SLC19A2O60779 497 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CLPSP04118 112 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CHRNGP07510 517 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ABOP16442 354 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 DDCP20711 480 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 MPIP34949 423 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 KANK2Q63ZY3 851 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 NOXRED1Q6NXP6 359 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SIAH3Q8IW03 269 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZNF615Q8N8J6 731 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 C16orf52Q8NHV5 167 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 TRAF6Q9Y4K3 522 aa24.87■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 TP53I11O14683 189 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 HS6ST1O60243 411 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.575e-6■■■■□ 21.9
BRD4-208ENST00000597315 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 NADKO95544 446 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 LDLRP01130 860 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 BPGMP07738 259 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 RNFT1Q5M7Z0 435 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 PAOXQ6QHF9 649 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 RGS9BPQ6ZS82 235 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SLC22A16Q86VW1 577 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 AGR3Q8TD06 166 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZNF681Q96N22 645 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 KCNK9Q9NPC2 374 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 MYNNQ9NPC7 610 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 DEPPQ9NTK1 212 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 PRODH2Q9UF12 536 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 NAV2Q8IVL1 2488 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 POLEQ07864 2286 aa24.86■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 FGF4P08620 206 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 FBXO45P0C2W1 286 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 LINC00032P0C843 101 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CCL3P10147 92 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 PTGER1P34995 402 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 PPIAP62937 165 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 RPP38P78345 283 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 LTB4RQ15722 352 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 IKBIPQ70UQ0 350 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 OR5M3Q8NGP4 307 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 TWIST2Q8WVJ9 160 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CNIH4Q9P003 139 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa24.85■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 CCL21O00585 134 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 TM9SF1O15321 606 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 PRPH2P23942 346 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 NTSP30990 170 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 KCNJ2P63252 427 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 MTFR2Q6P444 385 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 RNF165Q6ZSG1 346 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 C17orf47Q8NEP4 570 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 OR52R1Q8NGF1 315 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ZNF675Q8TD23 568 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 RELTQ969Z4 430 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa24.84■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 WDR91A4D1P6 747 aa24.83■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 FAM166BA8MTA8 275 aa24.83■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 WISP2O76076 250 aa24.83■■□□□ 1.57
BRD4-208ENST00000597315 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms