RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590638.5

NEDD4L-230, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-230ENST00000590638 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF225Q9UK10 706 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD4L-230ENST00000590638 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD4L-230ENST00000590638 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD4L-230ENST00000590638 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD4L-230ENST00000590638 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD4L-230ENST00000590638 PCM1Q15154 2024 aa7.4□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 LRP4O75096 1905 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 SLC16A8O95907 504 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 KRT6BP04259 564 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CAPN1P07384 714 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 KRT33BQ14525 404 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 IQCHQ86VS3 1027 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 DDIASQ8IXT1 998 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 PYCR2Q96C36 320 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.38□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 ERGP11308 486 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CTSEP14091 401 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 LBPP18428 481 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 GNAZP19086 355 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 EPORP19235 508 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 AOC1P19801 751 aa7.38□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 FOXL2P58012 376 aa7.38□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 NHLH1Q02575 133 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CHIT1Q13231 466 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PRKG2Q13237 762 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.38□□□□□ -1.23
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NEDD4L-230ENST00000590638 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 LCTLQ6UWM7 567 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 FRMD1Q8N878 549 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 C3orf30Q96M34 536 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.38□□□□□ -1.23
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