RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ACP5P13686 325 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 IL7RP16871 459 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 GRK3P35626 688 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 YAP1P46937 504 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CLK3P49761 638 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 SRP54P61011 504 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 MVKQ03426 396 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 REEP3Q6NUK4 255 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAL2Q969L2 176 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRAP1Q96NZ9 151 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 FAIM2Q9BWQ8 316 aa23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 SVOPQ8N4V2 548 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 PRORYQ9H606 182 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ENPP4Q9Y6X5 453 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 MICAQ29983 383 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 IGF2-ASQ6U949 168 aa23.96■■□□□ 1.43
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