RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 GID8Q9NWU2 228 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 VPS4AQ9UN37 437 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 A0A087WV62 115 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 A0A096LPI6 279 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 A8MUA0 341 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 C17orf105B2RV13 164 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PLOD2O00469 737 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 GSNP06396 782 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 KRT16P08779 473 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 UQCRC2P22695 453 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 OTX2P32243 289 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PTGER1P34995 402 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SOAT1P35610 550 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MC3RP41968 323 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CDKN2CP42773 168 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CPA2P48052 419 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PGDP52209 483 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MXRA7P84157 204 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PRR5P85299 388 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MAP4K2Q12851 820 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ART3Q13508 389 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SFT2D3Q587I9 215 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM107Q6UX40 140 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM64Q6YI46 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SZRD1Q7Z422 152 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 RAB43Q86YS6 212 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 KAT2AQ92830 837 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MOAP1Q96BY2 351 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 C8orf44Q96CB5 159 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 LRRC58Q96CX6 371 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ELP4Q96EB1 424 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 FBXL20Q96IG2 436 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 VPS50Q96JG6 964 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ART5Q96L15 291 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 LPAR4Q99677 370 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 NDE1Q9NXR1 346 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 MAP10Q9P2G4 905 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ACACBO00763 2458 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ZZEF1O43149 2961 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 A0A1W2PQ72 361 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 B2RBV5 119 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 UPK1AO00322 258 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PEX12O00623 359 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SOCS6O14544 535 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 EMC8O43402 210 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PLOD3O60568 738 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 PRAMEF2O60811 474 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 COQ9O75208 318 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 ATP5HO75947 161 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 UNC5CO95185 931 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 IFI6P09912 130 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF8-210ENST00000574217 CT62P0C5K7 136 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms