RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398571.6

USP34-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP34, Length 11,357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-201ENST00000398571 HSPA14Q0VDF9 509 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 SLC9A5Q14940 896 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.748e-7■■■□□ 18.6
USP34-201ENST00000398571 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 NEIL2Q969S2 332 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 OR4K3Q96R72 315 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 GDE1Q9NZC3 331 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 MYL12BO14950 172 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 LINC00271P0C7V0 271 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PRKCAP17252 672 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 FMO4P31512 558 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ERVK-21P61565 698 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 CRHR2Q13324 411 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 EFR3AQ14156 821 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 KRT33BQ14525 404 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TCEA2Q15560 299 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 MAPK11Q15759 364 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 C9orf131Q5VYM1 1079 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PPCDCQ96CD2 204 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 RAD1O60671 282 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 CKMP06732 381 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 FHP07954 510 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 NCK1P16333 377 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 DRD5P21918 477 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 24.6
USP34-201ENST00000398571 EIPR1Q53HC9 387 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 XKR6Q5GH73 641 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 DIO2Q92813 273 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 KATNB1Q9BVA0 655 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ZNF350Q9GZX5 532 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ZNF221Q9UK13 617 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 OBSL1O75147 1896 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PLPP1O14494 284 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 APBB3O95704 486 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 SOD1P00441 154 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 CALCBP10092 127 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 CEP68Q76N32 757 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TEKT2Q9UIF3 430 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TNFSF14O43557 240 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 CHP2O43745 196 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 HTR1FP30939 366 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 RFX2P48378 723 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 B4GALNT1Q00973 533 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 OTULINQ96BN8 352 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 A0A0A6YYD5 115 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PRAMEF4O60810 478 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 NUDT14O95848 222 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 KIR2DS3Q14952 304 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 GRK1Q15835 563 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 NTRK2Q16620 822 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 SYT14P1Q58G82 188 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 WDR88Q6ZMY6 472 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 OR2L13Q8N349 312 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 OR51F1A6NGY5 319 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 COX7A2P14406 83 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 HLA-GP17693 338 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 BMP7P18075 431 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 HK1P19367 917 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 EPHB3P54753 998 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 MTPNP58546 118 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 LAYNQ6UX15 382 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 CLHC1Q8NHS4 586 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.19□□□□□ -1.74
USP34-201ENST00000398571 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms