RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 VNN3Q9NY84 501 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPL8 197 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 M0QZQ0 153 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ13O60928 360 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OSMP13725 252 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DCTP40126 519 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ADH7P40394 386 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SOX9P48436 509 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 BMXP51813 675 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PNCKQ6P2M8 343 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ITPKCQ96DU7 683 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 H7C2Y5 167 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC6AO75865 159 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 HEXBP07686 556 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ELP5Q8TE02 316 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RAD9AQ99638 391 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RBCK1Q9BYM8 510 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ATG5Q9H1Y0 275 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 COPZ2Q9P299 210 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C74A6NCV1 312 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TTC34A8MYJ7 566 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 INHBCP55103 352 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NCS1P62166 190 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RTP2Q5QGT7 225 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR5T2Q8NGG2 359 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 C6P13671 934 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NTRK2Q16620 822 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K3Q96R72 315 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CD8B2A6NJW9 211 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 VSTM5A8MXK1 200 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CD8BP10966 210 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCAP17252 672 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 VEZF1Q14119 521 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 APCDD1Q8J025 514 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF559Q9BR84 538 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 LHPPQ9H008 270 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 MYH10P35580 1976 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQU0 124 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ACVR1BP36896 505 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RAB28P51157 221 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GATSQ8NAP1 163 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CD200R1Q8TD46 325 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NETO1Q8TDF5 533 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CHFRQ96EP1 664 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SORT1Q99523 831 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 BOCQ9BWV1 1114 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A7Q9GZV3 580 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 UCHL1P09936 223 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CD40LGP29965 261 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CNR2P34972 360 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RHEBQ15382 184 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RGNQ15493 299 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PTERQ96BW5 349 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK13-1Q9NX77 482 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL3Q9UKT7 428 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PGCP20142 388 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CAPZA1P52907 286 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CDK10Q15131 360 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GPR37L1O60883 481 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ADORA3P0DMS8 318 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO27Q8NI29 283 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 APIPQ96GX9 242 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 IL17CQ9P0M4 197 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PLD2O14939 933 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms