RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	LYPD8	Q6UX82	237 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	RPTN	Q6XPR3	784 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	GK5	Q6ZS86	529 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	DOK4	Q8TEW6	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	OXSM	Q9NWU1	459 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	TINAG	Q9UJW2	476 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	PSME2	Q9UL46	239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	NCKAP5	O14513	1909 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784		A0A0G2JMM0	328 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1W2PPB8	328 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1W2PRS3	328 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	PINLYP	A6NC86	204 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ACOT7	O00154	380 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784		P04436	131 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ATP1B1	P05026	303 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	FBXO45	P0C2W1	286 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	CT62	P0C5K7	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	CCL3	P10147	92 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	CHN1	P15882	459 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	KRT4	P19013	534 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	SERPINB3	P29508	390 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	SSTR4	P31391	388 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	HTR6	P50406	440 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	VSNL1	P62760	191 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	HSF1	Q00613	529 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	TAGAP	Q8N103	731 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	TP53INP1	Q96A56	240 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	KCNA7	Q96RP8	456 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	OR10A5	Q9H207	317 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	MID2	Q9UJV3	735 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	TIMM22	Q9Y584	194 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-231	ENST00000566784	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	PRRG2	O14669	202 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	PCDH7	O60245	1069 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	DRD2	P14416	443 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	CPA3	P15088	417 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	AGA	P20933	346 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	S1PR1	P21453	382 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	NT5E	P21589	574 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	PTGS2	P35354	604 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	GSTM5	P46439	218 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	NAGLU	P54802	743 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	PLGLB1	Q02325	96 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	MAP4K2	Q12851	820 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	ART3	Q13508	389 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	NTRK2	Q16620	822 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	CFAP157	Q5JU67	520 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	LIPM	Q5VYY2	423 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	WDR93	Q6P2C0	686 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	EMB	Q6PCB8	327 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	PAOX	Q6QHF9	649 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	MMP21	Q8N119	569 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	EID3	Q8N140	333 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC63	Q8NA47	563 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-231	ENST00000566784	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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