RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 MAGED4Q96JG8 741 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 PIF1Q9H611 641 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 FAM149AA5PLN7 773 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 C9orf172C9J069 976 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 OR10H2O60403 315 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 STK17BO94768 372 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 HSD17B1P14061 328 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 SPATS1Q496A3 300 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 SAXO2Q658L1 398 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 SZRD1Q7Z422 152 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 IFNEQ86WN2 208 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 FAM13CQ8NE31 585 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 OR10A6Q8NH74 314 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 SFXN5Q8TD22 340 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 FKBP10Q96AY3 582 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 ELP4Q96EB1 424 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 NEURL3Q96EH8 262 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 C14orf105Q9NVL8 296 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 CORO2BQ9UQ03 480 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.97■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 CEP250Q9BV73 2442 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 KCNK5O95279 499 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 KRT75O95678 551 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 ZGLP1P0C6A0 271 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 GPX2P18283 190 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 SERTAD2Q14140 314 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 LAPTM4BQ86VI4 370 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 MR1Q95460 341 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 TSLPQ969D9 159 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 DGAT2Q96PD7 388 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 VN1R1Q9GZP7 353 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 MKL2Q9ULH7 1088 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 USP22Q9UPT9 525 aa21.96■■□□□ 1.11
CLMN-205ENST00000556416 DNAJA2O60884 412 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 CIB2O75838 187 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 STT3AP46977 705 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 MVDP53602 400 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 FOXL2P58012 376 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 TP53BP2Q13625 1128 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 NKG7Q16617 165 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 MLIPQ5VWP3 458 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 RNF130Q86XS8 419 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 OR7G2Q8NG99 324 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 ZNF675Q8TD23 568 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 DOK4Q8TEW6 326 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 ZNF583Q96ND8 569 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 CHST8Q9H2A9 424 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 ANKRA2Q9H9E1 313 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 GPATCH2Q9NW75 528 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 MAT2BQ9NZL9 334 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 SDK2Q58EX2 2172 aa21.95■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 EMC8O43402 210 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 RECKO95980 971 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 SOX18P35713 384 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 CASP9P55211 416 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 RGNQ15493 299 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 COX20Q5RI15 118 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 FAM111BQ6SJ93 734 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 CALHM3Q86XJ0 350 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 OR52N2Q8NGI0 321 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 MOAP1Q96BY2 351 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 SLC26A1Q9H2B4 701 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 POMPQ9Y244 141 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 VSTM2BA6NLU5 285 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 PLOD2O00469 737 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 SLITRK5O94991 958 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 ALBP02768 609 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 CT62P0C5K7 136 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 GZMMP51124 257 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 PRR5P85299 388 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 VAC14Q08AM6 782 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 MGAT2Q10469 447 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 BIKQ13323 160 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 FAM198BQ6UWH4 519 aa21.94■■□□□ 1.1
CLMN-205ENST00000556416 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms