RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 DPPA5A6NC42 116 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 HRO43593 1189 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 JRKO75564 520 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ALPLP05186 524 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 FUT4P22083 530 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 RRM2P31350 389 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 GSSP48637 474 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PRR5P85299 388 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 BNC1Q01954 994 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 RBBP4Q09028 425 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SLC13A2Q13183 592 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 DAG1Q14118 895 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 OR7G2Q8NG99 324 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 THAP11Q96EK4 314 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SMIM10Q96HG1 83 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 C10orf90Q96M02 699 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ZNF681Q96N22 645 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 REEP1Q9H902 201 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PDE7BQ9NP56 450 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 OLAHQ9NV23 265 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CHST10O43529 356 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TPST2O60704 377 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TBX19O60806 448 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 FHP07954 510 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TFPTP0C1Z6 253 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ALDH3A2P51648 485 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CLCN2P51788 898 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ZNF786Q8N393 782 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ZG16BQ96DA0 208 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TCTN2Q96GX1 697 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 LILRA5A6NI73 299 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 VGLL3A8MV65 326 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 B4GAT1O43505 415 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 IFNA14P01570 189 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 THRBP10828 461 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CPMP14384 443 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 POU2F1P14859 743 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PPP2R1BP30154 601 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CTSKP43235 329 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CDH12P55289 794 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MYBPC1Q00872 1141 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 HLA-BQ31612 363 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 IFI44LQ53G44 452 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PMS2CLQ68D20 193 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ARL10Q8N8L6 244 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 EDAQ92838 391 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 C7orf34Q96L11 122 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MUS81Q96NY9 551 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TOR3AQ9H497 397 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 EXD2Q9NVH0 621 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms