RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRVP-201ENST00000482597 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRVP-201ENST00000482597 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GSTM5P46439 218 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 MLLT10P55197 1068 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CSNK1G2P78368 415 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 HTR4Q13639 388 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 BCL7AQ4VC05 210 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf226A1L170 272 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SNTNA6NMZ2 147 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 K7EQS6 105 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 B4GAT1O43505 415 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 KLK8O60259 260 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 APBB3O95704 486 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 HLA-DQA2P01906 255 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ACPPP15309 386 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CD22P20273 847 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PIK3CBP42338 1070 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ALDH3A2P51648 485 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 NCF4Q15080 339 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 COX20Q5RI15 118 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CCNJQ5T5M9 372 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR52L1Q8NGH7 329 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 NODALQ96S42 347 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CLEC1BQ9P126 229 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1B0GVT2 93 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUXAA6NLW8 204 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 H0YGG7 62 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 M0R3H8 397 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PLPP1O14494 284 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ACOT8O14734 319 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR6A2O95222 327 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 COQ5Q5HYK3 327 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SVOPLQ8N434 492 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR2L5Q8NG80 312 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 RSC1A1Q92681 617 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ARSGQ96EG1 525 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PHOX2BQ99453 314 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DOHHQ9BU89 302 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 BEX2Q9BXY8 128 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ARNTLO00327 626 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 UGT2B11O75310 529 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 IL9P15248 144 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DDCP20711 480 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1D4P47884 311 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TAS2R38P59533 333 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CSNK2BP67870 215 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP6AP1Q15904 470 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ALG11Q2TAA5 492 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXL6Q8N531 539 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SCAIQ8N9R8 606 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 AVL9Q8NBF6 648 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 FEVQ99581 238 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 MALT1Q9UDY8 824 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.4 ms