RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 TRIM10Q9UDY6 481 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 CD84Q9UIB8 345 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 BAG5Q9UL15 447 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 HPCAL4Q9UM19 191 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 LOC100653049A0A140TA62 436 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TIMM23O14925 209 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 MAPK13O15264 365 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 KRT34O76011 436 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 VENTXO95231 258 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 IGLV3-25P01717 112 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ZNF24P17028 368 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ITGA2P17301 1181 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 IL4RP24394 825 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 VEGFCP49767 419 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ACTG1P63261 375 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ZNF33BQ06732 778 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 BRAT1Q6PJG6 821 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 DPPA4Q7L190 304 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SIAH3Q8IW03 269 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 LIX1Q8N485 282 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 OR11G2Q8NGC1 345 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TAS1R2Q8TE23 839 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SLCO2A1Q92959 643 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 EID2BQ96D98 161 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 RAB33BQ9H082 229 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 MED12Q93074 2177 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TSPAN11A1L157 253 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SYT5O00445 386 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TCF21O43680 179 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 VEGFDO43915 354 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 GPRIN2O60269 458 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 PDE9AO76083 593 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 HPP00738 406 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TNFAIP3P21580 790 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 CDH3P22223 829 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 GCLMP48507 274 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ATP5J2P56134 94 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 RPS6KA2Q15349 733 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TAF5Q15542 800 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 KLHL35Q6PF15 583 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 PSMF1Q92530 271 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 C8orf44Q96CB5 159 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 DTD2Q96FN9 168 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ZNF696Q9H7X3 374 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 DHDHQ9UQ10 334 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ALG6Q9Y672 507 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 CADP27708 2225 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 A8MUI8 341 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 MAP2K7O14733 419 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 GRAP2O75791 330 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 CALCAP01258 141 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 VDRP11473 427 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 SERPINA4P29622 427 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 NSG1P42857 185 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 LMAN1P49257 510 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 FAM27E3Q08E93 113 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 MESDQ14696 234 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-232ENST00000481037 ACKR1Q16570 336 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms