RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	NDST1	P52848	882 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	LMO4	P61968	165 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	GPR142	Q7Z601	462 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	PHC2	Q8IXK0	858 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	ATF6B	Q99941	703 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	NT5DC2	Q9H857	520 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	NUDC	Q9Y266	331 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM89	A2RUT3	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RASGRF2	O14827	1237 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	PI15	O43692	258 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	HPR	P00739	348 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	IGHG1	P01857	330 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	PROS1	P07225	676 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SLC1A4	P43007	532 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	ASMT	P46597	345 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	TKTL1	P51854	596 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	PAX8	Q06710	450 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	NME3	Q13232	169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	ITPK1	Q13572	414 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	ENPP2	Q13822	863 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	EMC2	Q15006	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	HAGH	Q16775	308 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RPAIN	Q86UA6	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	CNNM3	Q8NE01	707 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	OR2L2	Q8NH16	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RASL10A	Q92737	203 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM45B	Q96B21	275 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	KRT23	Q9C075	422 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	LHX3	Q9UBR4	397 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	UBE4B	O95155	1302 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	AFF2	P51816	1311 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CLK1-208	ENST00000464454	RNF212B	A8MTL3	300 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	CFLAR	O15519	480 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	STAM2	O75886	525 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	TGFA	P01135	160 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	GSTA1	P08263	222 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	ACADS	P16219	412 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	CCNA2	P20248	432 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	CALML3	P27482	149 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	TMOD1	P28289	359 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	MATK	P42679	507 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	PTGER3	P43115	390 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	RABIF	P47224	123 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	SLC6A8	P48029	635 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	NPY2R	P49146	381 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	ATP4B	P51164	291 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CLK1-208	ENST00000464454	GSTO1	P78417	241 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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