RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 BRINP2Q9C0B6 783 aa17.1■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa17.1■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.1■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 OR6C76A6NM76 312 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 HRKO00198 91 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 TACR1P25103 407 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 NTSP30990 170 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 CYB561P49447 251 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 SSR4P51571 173 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 PPP2R2AP63151 447 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 TLE1Q04724 770 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 C6orf136Q5SQH8 315 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 FAM180BQ6P0A1 224 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 TMEM156Q8N614 296 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 NUBPLQ8TB37 319 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 DYDC1Q8WWB3 177 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 PPP1R36Q96LQ0 422 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 C3orf30Q96M34 536 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 TSSK3Q96PN8 268 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 BBS4Q96RK4 519 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 LRFN1Q9P244 771 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 MAP10Q9P2G4 905 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 MYOTQ9UBF9 498 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 GIMAP2Q9UG22 337 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.09■□□□□ 0.33
DDR1-241ENST00000460944 KLF11O14901 512 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 PRAMEF2O60811 474 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 SNNO75324 88 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 CT62P0C5K7 136 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 BCKDHAP12694 445 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 DDX5P17844 614 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 CD96P40200 585 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 HLCSP50747 726 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 HK2P52789 917 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 OR1C1Q15619 314 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 C9orf40Q8IXQ3 194 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 CCDC116Q8IYX3 515 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 FAM9CQ8IZT9 166 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 OR7G1Q8NGA0 311 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 CLHC1Q8NHS4 586 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 EGLN2Q96KS0 407 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 C5orf34Q96MH7 638 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 ZNF681Q96N22 645 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 GAL3ST4Q96RP7 486 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 C1orf50Q9BV19 199 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 PNPOQ9NVS9 261 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 SVILO95425 2214 aa17.08■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 FASNP49327 2511 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 SLCO1B7G3V0H7 640 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 WWP2O00308 870 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 VPS4BO75351 444 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 OR2J2O76002 312 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 JUNP05412 331 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 PRPS2P11908 318 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 CD46P15529 392 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 SSTR4P31391 388 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 MPIP34949 423 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 HPCAL1P37235 193 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 RPL3P39023 403 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 ST13P50502 369 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 MLLT10P55197 1068 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 SLC37A1P57057 533 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 FUT7Q11130 342 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 MAP4K2Q12851 820 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 LTB4RQ15722 352 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 ZNF766Q5HY98 468 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 ADCY4Q8NFM4 1077 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 CPT1CQ8TCG5 803 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 ASB15Q8WXK1 588 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 TMEM125Q96AQ2 219 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 PPCDCQ96CD2 204 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 NUF2Q9BZD4 464 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 OR10A5Q9H207 317 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 REEP4Q9H6H4 257 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 TAS2R7Q9NYW3 318 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 MAT2BQ9NZL9 334 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 BCAP29Q9UHQ4 241 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 CFL2Q9Y281 166 aa17.07■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 TMEM200CA6NKL6 621 aa17.06■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 A8MVJ9 347 aa17.06■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 AKAP10O43572 662 aa17.06■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 LRATO95237 230 aa17.06■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 PLA2G2AP14555 144 aa17.06■□□□□ 0.32
DDR1-241ENST00000460944 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms