RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.13■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC6A18Q96N87 628 aa15.13■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa15.13■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PRQ8 180 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ISPDA4D126 451 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 M0R3H8 397 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PKLRP30613 574 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GPC1P35052 558 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRKCDQ05655 676 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OPALINQ96PE5 141 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KCNK12Q9HB15 430 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KCNK6Q9Y257 313 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRR19A6NJB7 356 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 H3BN98 237 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA0513O60268 411 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 STATHP02808 62 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NR2F1P10589 423 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SMIM11AP58511 58 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 RHAGQ02094 409 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FUT5Q11128 374 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CBX3Q13185 183 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ENPP2Q13822 863 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GPR19Q15760 415 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SZRD1Q7Z422 152 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TTLQ8NG68 377 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR2L8Q8NGY9 312 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 BCL2L10Q9HD36 194 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ASB4Q9Y574 426 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PP55 124 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GLOD5A6NK44 160 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR8J1Q8NGP2 316 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KLK6Q92876 244 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HHATLQ9HCP6 504 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GDE1Q9NZC3 331 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.12■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PGRMC2O15173 223 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GPX5O75715 221 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 UGT2B17O75795 530 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CHRM4P08173 479 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF45Q02386 682 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CDC20Q12834 499 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC9A5Q14940 896 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NCF4Q15080 339 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 STEAP3Q658P3 488 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FAIM2Q9BWQ8 316 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PR48 441 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TBX1O43435 398 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SCG5P05408 212 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CEACAM5P06731 702 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PTGER1P34995 402 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 DUSP2Q05923 314 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC13A2Q13183 592 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLAMF1Q13291 335 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CASP12Q6UXS9 341 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM64Q6YI46 380 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms