RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SGCZQ96LD1 299 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFL2Q9Y281 166 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RELNP78509 3460 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A1B0GUH1 482 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ASPDHA6ND91 283 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HRKO00198 91 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEC22BO75396 215 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR6B1O95007 311 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MST1P26927 711 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SERPINB5P36952 375 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC37A1P57057 533 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNK10P57789 538 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C2orf80Q0P641 193 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PIGGQ5H8A4 983 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLEC6AQ6EIG7 209 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MDGA2Q7Z553 956 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DDIASQ8IXT1 998 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAGED4Q96JG8 741 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FRMD6Q96NE9 622 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BBS4Q96RK4 519 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MECRQ9BV79 373 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR10A5Q9H207 317 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACOT7O00154 380 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEMA7AO75326 666 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP1B1P05026 303 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SSTR4P31391 388 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPIP34949 423 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TDGF1P3P51864 188 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR85P60893 370 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAE1P78406 368 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FUT7Q11130 342 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C4orf17Q53FE4 359 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GK5Q6ZS86 529 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MMP21Q8N119 569 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GHDCQ8N2G8 530 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM13CQ8NE31 585 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TP53INP1Q96A56 240 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR137Q96N19 417 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZIM3Q96PE6 472 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1orf109Q9NX04 203 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EHD3Q9NZN3 535 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HEY2Q9UBP5 337 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRODH2Q9UF12 536 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRAF6Q9Y4K3 522 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POLEQ07864 2286 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRK2Q5S007 2527 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A1W2PS29 197 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR91A4D1P6 747 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TP53I11O14683 189 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TM9SF1O15321 606 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRTM2O43300 516 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ASNA1O43681 348 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms