RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346501.8

TSPAN4-201, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TSPAN4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-201ENST00000346501 MTFR2Q6P444 385 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 PAOXQ6QHF9 649 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 GK5Q6ZS86 529 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 GHDCQ8N2G8 530 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 APIPQ96GX9 242 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 FRMD6Q96NE9 622 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SEMA7AO75326 666 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SEC22BO75396 215 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 ATP1B1P05026 303 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 IL3P08700 152 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 MST1P26927 711 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 ALDH3A1P30838 453 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 MPIP34949 423 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 TDGF1P3P51864 188 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC37A1P57057 533 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 KCNK10P57789 538 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SULF2Q8IWU5 870 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 EID3Q8N140 333 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 TP53INP1Q96A56 240 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 GPR137Q96N19 417 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 OR10A5Q9H207 317 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 EHD3Q9NZN3 535 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 BSNQ9UPA5 3926 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 TP53I11O14683 189 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 LRRTM2O43300 516 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 ASNA1O43681 348 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 STSP08842 583 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 ABOP16442 354 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 CNR1P21554 472 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SSTR4P31391 388 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 FOXA1P55317 472 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 GPR85P60893 370 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF844Q08AG5 666 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 C2orf80Q0P641 193 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 FUT7Q11130 342 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 MAP4K2Q12851 820 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 MDGA2Q7Z553 956 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 DDIASQ8IXT1 998 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 DOK4Q8TEW6 326 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 UCN3Q969E3 161 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 BBS4Q96RK4 519 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 EBPLQ9BY08 206 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 PRODH2Q9UF12 536 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 TENM4Q6N022 2769 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-201ENST00000346501 HRKO00198 91 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 NTSP30990 170 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 FAM13CQ8NE31 585 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-201ENST00000346501 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms