RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB38P57729 211 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 VLDLRP98155 873 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 INAVAQ3KP66 663 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SZRD1Q7Z422 152 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 D2HGDHQ8N465 521 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CBR4Q8N4T8 237 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 EID2Q8N6I1 236 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP76Q8TAP6 659 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SFXN5Q8TD22 340 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GIMAP5Q96F15 307 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51I1Q9H343 314 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP54Q96N23 3096 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CPED1A4D0V7 1026 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MU76 341 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 DLGAP1O14490 977 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP33O14559 1287 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 FOLR1P15328 257 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 IST1P53990 364 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ10P78508 379 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NR0B2Q15466 257 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT16Q17RD7 645 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM111BQ6SJ93 734 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 COL26A1Q96A83 441 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF597Q96LX8 424 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NTMQ9P121 344 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 M0QX08 132 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BCHEP06276 602 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 FHP07954 510 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 OR12D1P0DN82 309 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 GCGRP47871 477 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SELENOWP63302 87 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 FUT5Q11128 374 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TCTE1Q5JU00 501 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM19Q96HH6 336 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 C7orf34Q96L11 122 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NINQ8N4C6 2090 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 YKT6O15498 198 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 EMC8O43402 210 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR75O95800 540 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CST1P01037 141 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP1B1P05026 303 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MATN1P21941 496 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MAN2A2P49641 1150 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SQSTM1Q13501 440 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 REEP3Q6NUK4 255 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1L3Q8NH93 324 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 DOK4Q8TEW6 326 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TANKQ92844 425 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TMBIM1Q969X1 311 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TPD52L3Q96J77 140 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS50Q96JG6 964 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BTBD9Q96Q07 612 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 DOHHQ9BU89 302 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BDH2Q9BUT1 245 aa8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms