RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 VPS72Q15906 364 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 POLA2Q14181 598 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 UTYO14607 1347 aa20.95■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 A0A0G2JS52 829 aa20.95■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 GCKRQ14397 625 aa20.95■□□□□ 0.95
SH3BP2-228ENST00000515737 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 STARD3NLO95772 234 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 USP21Q9UK80 565 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 MTX1Q13505 466 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 SUCLG2Q96I99 432 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 MSH5O43196 834 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 KAZALD1Q96I82 304 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-228ENST00000515737 RAB11FIP3O75154 756 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 MYT1Q01538 1121 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 TTC22Q5TAA0 569 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 A0A087WZG4 1122 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 PDE1AP54750 535 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 KCNQ2O43526 872 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 ARXQ96QS3 562 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 MX1P20591 662 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-228ENST00000515737 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 ATP6V1AP38606 617 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 CASP7P55210 303 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 SIK1P57059 783 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 AFF2P51816 1311 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 H7C1W4 665 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 TCIRG1Q13488 830 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 TJP1Q07157 1748 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 SDSP20132 328 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 CDC45O75419 566 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 COL15A1P39059 1388 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 PALLDQ8WX93 1383 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 STAP2Q9UGK3 403 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 ITPK1Q13572 414 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 HLFQ16534 295 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 SIL1Q9H173 461 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-228ENST00000515737 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
SH3BP2-228ENST00000515737 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
SH3BP2-228ENST00000515737 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms