RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
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HOXB3-212ENST00000498678 POLA2Q14181 598 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXB3-212ENST00000498678 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
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HOXB3-212ENST00000498678 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.37■■■□□ 2.77
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HOXB3-212ENST00000498678 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
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HOXB3-212ENST00000498678 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.3■■■□□ 2.76
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HOXB3-212ENST00000498678 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.22■■■□□ 2.75
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HOXB3-212ENST00000498678 COL15A1P39059 1388 aa32.2■■■□□ 2.75
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HOXB3-212ENST00000498678 SEPT12Q8IYM1 358 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXB3-212ENST00000498678 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXB3-212ENST00000498678 RREB1Q92766 1687 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXB3-212ENST00000498678 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXB3-212ENST00000498678 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXB3-212ENST00000498678 ERC1Q8IUD2 1116 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXB3-212ENST00000498678 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXB3-212ENST00000498678 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
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