RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.31■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.31■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.3■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.3■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 GRM8O00222 908 aa26.3■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.29■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.28■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 SSH3Q8TE77 659 aa26.28■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 SRGAP3O43295 1099 aa26.27■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 SEC24BO95487 1268 aa26.27■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 GCKRQ14397 625 aa26.27■■□□□ 1.8
RFXAP-201ENST00000255476 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.26■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 KCNQ2O43526 872 aa26.26■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 SUCLG2Q96I99 432 aa26.26■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.25■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 KAZALD1Q96I82 304 aa26.25■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 UTYO14607 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 STARD3NLO95772 234 aa26.25■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 POLA2Q14181 598 aa26.25■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.25■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 AFF2P51816 1311 aa26.24■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 TJP1Q07157 1748 aa26.22■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.2■■□□□ 1.79
RFXAP-201ENST00000255476 FAM182BQ5T319 152 aa26.2■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 ARXQ96QS3 562 aa26.2■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 MTX1Q13505 466 aa26.19■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.19■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.19■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.19■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.18■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 A0A087WZG4 1122 aa26.17■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.17■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.17■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.17■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.16■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 ATP6V1AP38606 617 aa26.16■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.15■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 SIK1P57059 783 aa26.15■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 PALLDQ8WX93 1383 aa26.15■■□□□ 1.78
RFXAP-201ENST00000255476 ITPK1Q13572 414 aa26.13■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 TTC22Q5TAA0 569 aa26.13■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.13■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.13■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 CASP7P55210 303 aa26.13■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.13■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 RAB11FIP3O75154 756 aa26.11■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 PDE1AP54750 535 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 TCIRG1Q13488 830 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 HLFQ16534 295 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 ATRNO75882 1429 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 H7C1W4 665 aa26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.09■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 KCNQ4P56696 695 aa26.09■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.09■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.09■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.08■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.08■■□□□ 1.77
RFXAP-201ENST00000255476 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 MX1P20591 662 aa26.07■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 SIL1Q9H173 461 aa26.07■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.07■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.06■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.06■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.06■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.05■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 SDSP20132 328 aa26.05■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 GPTP24298 496 aa26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms