RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254976.6

SNAP25-201, Transcript of synaptosome associated protein 25, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAP25, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25-201ENST00000254976 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.07■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.07■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 C8orf34Q49A92 452 aa16.07■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.07■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.07■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 ATRNO75882 1429 aa16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 HMMRO75330 724 aa16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 GRM8O00222 908 aa16.05■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 STARD3NLO95772 234 aa16.05■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa16.05■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 GCKRQ14397 625 aa16.04■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 FAM161AQ3B820 660 aa16.04■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 KAZALD1Q96I82 304 aa16.04■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 SUCLG2Q96I99 432 aa16.04■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.04■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 BTAF1O14981 1849 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 SBF2Q86WG5 1849 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 ARXQ96QS3 562 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 PALLDQ8WX93 1383 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 SRGAP3O43295 1099 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 ATP6V1AP38606 617 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 SIK1P57059 783 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 ITPK1Q13572 414 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 SSH3Q8TE77 659 aa16.03■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 UTYO14607 1347 aa16.02■□□□□ 0.16
SNAP25-201ENST00000254976 KCNQ4P56696 695 aa16.02■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 POLA2Q14181 598 aa16.01■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.01■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.01■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.01■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 NUP98P52948 1817 aa16■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 NHSQ6T4R5 1651 aa16■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 A0A087WZG4 1122 aa15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 HLFQ16534 295 aa15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 EP400Q96L91 3159 aa15.99■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 SEC24BO95487 1268 aa15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 CASP7P55210 303 aa15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 MTX1Q13505 466 aa15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.97■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.97■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 RREB1Q92766 1687 aa15.97■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 TCIRG1Q13488 830 aa15.96■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.96■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.96■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.96■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.96■□□□□ 0.15
SNAP25-201ENST00000254976 H7C1W4 665 aa15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 GPTP24298 496 aa15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.95■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.94■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.94■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 SMIM5Q71RC9 77 aa15.94■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.93■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 LY75O60449 1722 aa15.92■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.92■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 FOXO4P98177 505 aa15.92■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.92■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 SYNE4Q8N205 404 aa15.92■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 SIL1Q9H173 461 aa15.92■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SNAP25-201ENST00000254976 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms