RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC42P60953 191 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MED22Q15528 200 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXL6Q8N531 539 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.17□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.17□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCND3Q9UK17 655 aa11.17□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BN98 237 aa11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM23P36406 574 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERPINB10P48595 397 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB28P51157 221 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB8AP61006 207 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MLIPQ5VWP3 458 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCRL4Q96PJ5 515 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ENTPD6O75354 484 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEACAM5P06731 702 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NR2F1P10589 423 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GDI1P31150 447 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLAMF1Q13291 335 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IQCF1Q8N6M8 205 aa11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DSN1Q9H410 356 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXL12Q9NXK8 326 aa11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.16□□□□□ -0.62
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAT1O14929 419 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZW10O43264 779 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNTTP04053 509 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNNI3P19429 210 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSD17B2P37059 387 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRKP42685 505 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNJ5P48544 419 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCAP31P51572 246 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SGCGQ13326 291 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCST1Q5T197 706 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C18orf63Q68DL7 685 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YAF2Q8IY57 180 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf58Q96GQ5 468 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q96MT0 163 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 QRFPRQ96P65 431 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GDE1Q9NZC3 331 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNE3Q9Y6H6 103 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PQU0 124 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PR48 441 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RFXAPO00287 272 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NTN1O95631 604 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CKMT1AP12532 417 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGS6P49758 472 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HYAL2Q12891 473 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PARM1Q6UWI2 310 aa11.15□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCGR1BQ92637 280 aa11.15□□□□□ -0.62
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