RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589759.1

ATP6V0A1-223, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 3

Gene ATP6V0A1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PAM	P19021	973 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CXCL2	P19875	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ITGA3	P26006	1051 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NOS3	P29474	1203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PDHA2	P29803	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SSTR4	P31391	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	S100A11	P31949	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BTC	P35070	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PMEL	P40967	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRAT	P43155	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	EVX1	P49640	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CTSC	P53634	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZP1	P60852	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RAP2B	P61225	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PICALM	Q13492	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TDG	Q13569	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MTMR1	Q13613	665 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LRRC32	Q14392	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MED22	Q15528	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PYURF	Q96I23	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NELL2	Q99435	816 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OMD	Q99983	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms