RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469334.5

SMARCE1-207, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 2,128 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-207ENST00000469334 PLD1Q13393 1074 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MADCAM1Q13477 382 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GRIN2CQ14957 1233 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CHRNA6Q15825 494 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ANKRD46Q86W74 232 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GPR65Q8IYL9 337 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SPICQ8N5J4 248 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ELP5Q8TE02 316 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ESAMQ96AP7 390 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PIP5K1AQ99755 562 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NTMT1Q9BV86 223 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CHST8Q9H2A9 424 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GPR160Q9UJ42 338 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PPEF2O14830 753 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 HCRTO43612 131 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RAD1O60671 282 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NBNO60934 754 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SC5DO75845 299 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 HTR3BO95264 441 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GLAP06280 429 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 THP07101 528 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MMP2P08253 660 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OSMP13725 252 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 LMO2P25791 158 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 S100A11P31949 105 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PITPNBP48739 271 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 HMGCS1Q01581 520 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MC2RQ01718 297 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ILKQ13418 452 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PTPRCAPQ14761 206 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ZBTB6Q15916 424 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CASP12Q6UXS9 341 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 STX12Q86Y82 276 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 KRT78Q8N1N4 520 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SYT14Q8NB59 555 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GPR26Q8NDV2 337 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 REPS2Q8NFH8 660 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 WDR20Q8TBZ3 569 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC6A18Q96N87 628 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PANX1Q96RD7 426 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DDOQ99489 341 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MNTQ99583 582 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MED11Q9P086 117 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PPT2Q9UMR5 302 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 KCTD3Q9Y597 815 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-207ENST00000469334 HMSDA8MTL9 139 aa8.58□□□□□ -1.04
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