RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362378.1

RNU6-28P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 28, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-28P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-28P-201ENST00000362378 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 NCLNQ969V3 563 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PNPLA2Q96AD5 504 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 NACA2Q9H009 215 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PARLQ9H300 379 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 MIOXQ9UGB7 285 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF724A8MTY0 619 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 SH2D1BO14796 132 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 BUB1O43683 1085 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 GUCA1CO95843 209 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 HEXBP07686 556 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 IL4RP24394 825 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 KRTAP5-9P26371 169 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRKCEQ02156 737 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 NME3Q13232 169 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 SCGB2A2Q13296 93 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 HAGHQ16775 308 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ASRGL1Q7L266 308 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 AMZ2Q86W34 360 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CARM1Q86X55 608 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CERS5Q8N5B7 392 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 BCORP1Q8N888 145 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CCDC51Q96ER9 411 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ART5Q96L15 291 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 AGAP4Q96P64 663 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 DEFB118Q96PH6 123 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 STARD5Q9NSY2 213 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ANKMY1Q9P2S6 941 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF175Q9Y473 711 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 U3KQV3 271 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 E9PMD0 336 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 SGK494L7N484 410 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 FBP2O00757 339 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 NDC80O14777 642 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CLDN3O15551 220 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 IGKV3-20P01619 116 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMOD1P28289 359 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRDX2P32119 198 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 MATKP42679 507 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CALCOCO2Q13137 446 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ARSKQ6UWY0 536 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 METTL4Q8N3J2 472 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 MLKLQ8NB16 471 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRSS33Q8NF86 280 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 FCGR1BQ92637 280 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 LGMNQ99538 433 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-28P-201ENST00000362378 DPH5Q9H2P9 285 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms