RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 BTKQ06187 659 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PCLAFQ15004 111 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR8K3Q8NH51 312 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PRR7Q8TB68 274 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 RIT1Q92963 219 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SCMH1Q96GD3 660 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 APIPQ96GX9 242 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SMC6Q96SB8 1091 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ACPTQ9BZG2 426 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OLAHQ9NV23 265 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MYOTQ9UBF9 498 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.51□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PS29 197 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 C1orf226A1L170 272 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 WWP2O00308 870 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CRCPO75575 148 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR2J2O76002 312 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 IGKV3-11P04433 115 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 UROSP10746 265 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 EDN3P14138 238 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ALDH3A1P30838 453 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SSR4P51571 173 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 XKP51811 444 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 HK2P52789 917 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ERVK-8P63133 956 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PMP22Q01453 160 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF844Q08AG5 666 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 KRT71Q3SY84 523 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FHL5Q5TD97 284 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MMP21Q8N119 569 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TMEM156Q8N614 296 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 NR4A3Q92570 626 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ART5Q96L15 291 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 C5orf34Q96MH7 638 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MCM8Q9UJA3 840 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.5□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ASPDHA6ND91 283 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TYROBPO43914 113 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PCDH7O60245 1069 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SEMA7AO75326 666 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A12O75746 678 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 WISP2O76076 250 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CT62P0C5K7 136 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 NT5EP21589 574 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MST1P26927 711 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ALDH9A1P49189 494 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TDGF1P3P51864 188 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ASPHQ12797 758 aa8.49□□□□□ -1.05
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