RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 ADRA1AP35348 466 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 VHLP40337 213 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CHRNA4P43681 627 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PITPNBP48739 271 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SPINT3P49223 89 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PGDP52209 483 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 NUP107P57740 925 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PTSQ03393 145 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ARHGEF7Q14155 803 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ITIH4Q14624 930 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 INPP5AQ14642 412 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SMCO1Q147U7 214 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ACOX1Q15067 660 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PON3Q15166 354 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC1A5Q15758 541 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CYP1B1Q16678 543 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PHF19Q5T6S3 580 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 LIPNQ5VXI9 398 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 KCTD11Q693B1 232 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PNCKQ6P2M8 343 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 Q6ZVL8 140 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PID1Q7Z2X4 250 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 JADE3Q92613 823 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PROX1Q92786 737 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 LURAP1Q96LR2 239 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SERPINB12Q96P63 405 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 OR1F2PQ96R84 312 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 APOOQ9BUR5 198 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 COG4Q9H9E3 785 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SIAEQ9HAT2 523 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 FGF22Q9HCT0 170 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF14Q9UBS8 474 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PLLPQ9Y342 182 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 OR1A2Q9Y585 309 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.96□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CACNA1DQ01668 2161 aa6.96□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM202A6NGA9 273 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 LINC00587B1AMM8 73 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 H3BML4 177 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 K7EM74 188 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CLDN4O14493 209 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 AURKAO14965 403 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC22A2O15244 555 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 NKX2-8O15522 239 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SEMA7AO75326 666 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ANXA9O76027 345 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SPDEFO95238 335 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CLDN7O95471 211 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 METTL18O95568 372 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MBP02144 154 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 FGGP02679 453 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 FGF1P05230 155 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 GNLYP22749 145 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CXCR5P32302 372 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 OR3A3P47888 321 aa6.95□□□□□ -1.3
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