RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430853.5

TTC28-AS1-211, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 564 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCDC22O60826 627 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LDB3O75112 727 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLITRK5O94991 958 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LRATO95237 230 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IL6P05231 212 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CPMP14384 443 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 COX7A2P14406 83 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MPIP34949 423 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 STT3AP46977 705 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR4D2P58180 307 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PLIN5Q00G26 463 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LRRC74AQ0VAA2 488 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CPZQ66K79 652 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MMP21Q8N119 569 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR8J2Q8NGG1 315 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CLHC1Q8NHS4 586 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF681Q96N22 645 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CATSPER2Q96P56 530 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DGAT2Q96PD7 388 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF700Q9H0M5 742 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CLMPQ9H6B4 373 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SH3BP4Q9P0V3 963 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FREM2Q5SZK8 3169 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 APC2O95996 2303 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DYTNA2CJ06 578 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR2W5A6NFC9 320 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MYO1GB0I1T2 1018 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SOCS6O14544 535 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLC22A2O15244 555 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EFSO43281 561 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ATP1B1P05026 303 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IFI6P09912 130 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ICAM2P13598 275 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GPX3P22352 226 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NTSP30990 170 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OTX2P32243 289 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FRKP42685 505 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EFNA3P52797 238 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UFM1P61960 85 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 AP2B1P63010 937 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IL10RAQ13651 578 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MLC1Q15049 377 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ANXA8L1Q5VT79 327 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIRREL2Q6UWL6 708 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCDC81Q6ZN84 652 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NDUFAF7Q7L592 441 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR4N5Q8IXE1 308 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ANKS4BQ8N8V4 417 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 VPS37AQ8NEZ2 397 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR11G2Q8NGC1 345 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR14A16Q8NHC5 309 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZFP28Q8NHY6 868 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TSLPQ969D9 159 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UCN3Q969E3 161 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ERP27Q96DN0 273 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ART5Q96L15 291 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BBS4Q96RK4 519 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LPAR4Q99677 370 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TUBB6Q9BUF5 446 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF385DQ9H6B1 395 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WDR70Q9NW82 654 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RAXQ9Y2V3 346 aa12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 URB1O60287 2271 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM234BA2RU67 622 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TGFBR3LH3BV60 316 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PDPK1O15530 556 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR10H2O60403 315 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HPP00738 406 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IFNA16P05015 189 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 S100A3P33764 101 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIR3DL1P43629 444 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TMPRSS3P57727 454 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FOXL2P58012 376 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TLE3Q04726 772 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms