RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NANOGQ9H9S0 305 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 VAPAQ9P0L0 249 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SCN2AQ99250 2005 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CLIC1O00299 241 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 DYRK3O43781 588 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GFRA3O60609 400 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 B4GALT2O60909 372 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CPMP14384 443 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CDKN2CP42773 168 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR1D4P47884 311 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MAPK10P53779 464 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MTPNP58546 118 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 BNIP2Q12982 314 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SERTAD2Q14140 314 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PIGGQ5H8A4 983 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 BMPERQ8N8U9 685 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SFXN5Q8TD22 340 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PHF12Q96QT6 1004 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CTRCQ99895 268 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TRIM15Q9C019 465 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MUC13Q9H3R2 512 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ALG2Q9H553 416 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 LAMA1P25391 3075 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 C9J4A7 227 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FAM227AF5H4B4 570 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NME4O00746 187 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CTNSO60931 367 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 LDB3O75112 727 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 HSD17B1P14061 328 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 LIPEQ05469 1076 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CEBPEQ15744 281 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CYP51A1Q16850 503 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SYT16Q17RD7 645 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MPEG1Q2M385 716 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GTDC1Q4AE62 458 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 RABL3Q5HYI8 236 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM64Q6YI46 380 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 DGAT2Q96PD7 388 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TAAR9Q96RI9 348 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 DDA1Q9BW61 102 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PISDQ9UG56 409 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 PLD2O14939 933 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 GSTA4O15217 222 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 FGF17O60258 216 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 DNAJB6O75190 326 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NTRK1P04629 796 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 ATP1B1P05026 303 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CCL4P13236 92 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CEACAM1P13688 526 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 NT5EP21589 574 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 MAGEA8P43361 318 aa14.48□□□□□ -0.09
VAMP1-202ENST00000396308 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms