RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 GRM7Q14831 915 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 THAP4Q8WY91 577 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PMEPA1Q969W9 287 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TOR1BO14657 336 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 LPLP06858 475 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PNMTP11086 282 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF35P13682 527 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ETV6P41212 452 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM135Q86UB9 458 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PIM3Q86V86 326 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KCT2Q8NC54 265 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF516Q92618 1163 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 AXIN1O15169 862 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PRAMEF2O60811 474 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 JRKO75564 520 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 IFNA5P01569 189 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CD3GP09693 182 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 UFM1P61960 85 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 GALK2Q01415 458 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OR5AK3PQ8NH89 298 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TMED9Q9BVK6 235 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TAS2R31P59538 309 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 NADK2Q4G0N4 442 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 WDSUB1Q8N9V3 476 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SNAPC3Q92966 411 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ISOC1Q96CN7 298 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 HPF1Q9NWY4 346 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RARRES3Q9UL19 164 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 HCN2Q9UL51 889 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TGFB1P01137 390 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CSF1P09603 554 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CARM1Q86X55 608 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SMPDL3BQ92485 455 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MYRFLQ96LU7 910 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM68Q96MH6 324 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ICKQ9UPZ9 632 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CENPBD1B2RD01 187 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA0355O15063 1070 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TP73O15350 636 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 DENRO43583 198 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 THEGLP0DJG4 465 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEA8P43361 318 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TBPL1P62380 186 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CSNK1A1LQ8N752 337 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CENPMQ9NSP4 180 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 HSD17B1P14061 328 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 S100PP25815 95 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 THBS2P35442 1172 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ARSKQ6UWY0 536 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ARL14Q8N4G2 192 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.77□□□□□ -1.49
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