RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NADK2Q4G0N4 442 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR8K3Q8NH51 312 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PSMF1Q92530 271 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 A8MUA0 341 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C17orf105B2RV13 164 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MASP2O00187 686 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 LDB3O75112 727 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DRD2P14416 443 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ALDH3A1P30838 453 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FOLH1Q04609 750 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TLE1Q04724 770 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HSDL2Q6YN16 418 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CUZD1Q86UP6 607 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MFRPQ9BY79 579 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 EPN3Q9H201 632 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1B0GTL3 188 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMPRSS11DO60235 418 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH7O60245 1069 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 AIFM1O95831 613 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 BPGMP07738 259 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FGF4P08620 206 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC35E2P0CK97 266 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GRK2P25098 689 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TNFSF10P50591 281 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NCLNQ969V3 563 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ACPTQ9BZG2 426 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TIMM22Q9Y584 194 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PR48 441 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR6C76A6NM76 312 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM114B3SHH9 223 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FGF17O60258 216 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS4BO75351 444 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CELA2AP08217 269 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CD46P15529 392 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PRPH2P23942 346 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINB4P48594 390 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC18A1P54219 525 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C18orf63Q68DL7 685 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RIT1Q92963 219 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXL20Q96IG2 436 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C5orf34Q96MH7 638 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNA7Q96RP8 456 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HBEGFQ99075 208 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms