RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555296.1

MED6-208, Transcript of mediator complex subunit 6, human

TSL 2

Gene MED6, Length 856 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED6-208	ENST00000555296	PRELP	P51888	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	AP1B1	Q10567	949 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CBX3	Q13185	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	JPT2	Q9H910	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SFTPB	P07988	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	FCAR	P24071	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SHC1	P29353	583 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ID1	P41134	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SLC1A6	P48664	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	HERV-K104	P63124	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	KRT31	Q15323	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	RASL10A	Q92737	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ANXA9	O76027	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SERPINF2	P08697	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	AREG	P15514	252 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	LMO2	P25791	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SP140L	Q9H930	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	TLR4	O00206	839 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CHEK1	O14757	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CXCL14	O95715	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	ZNF18	P17022	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	GEM	P55040	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	GALK2	Q01415	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED6-208	ENST00000555296	P2RY14	Q15391	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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