RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FAM170A	A1A519	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908		O00370	1275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UBE2C	O00762	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RAD51C	O43502	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MED7	O43513	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TOMM70	O94826	608 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PGK1	P00558	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FGG	P02679	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CHRNA1	P02708	482 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	AMBP	P02760	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CALB1	P05937	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RNF224	P0DH78	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	VDR	P11473	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	P4HA1	P13674	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CA4	P22748	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MC5R	P33032	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DNA2	P51530	1060 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NDST1	P52848	882 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RWDD2B	P57060	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TNNC1	P63316	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CBX1	P83916	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SP3	Q02447	781 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GPR17	Q13304	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TRADD	Q15628	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GINS2	Q9Y248	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HES2	Q9Y543	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908		F8VP50	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN4	O14493	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KLF11	O14901	512 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SPOP	O43791	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ASGR1	P07306	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HMBS	P08397	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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