RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PARD3Q8TEW0 1356 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 E5RGE8 158 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBR2O15453 112 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STAG3L1P0CL83 205 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRIP1P48552 1158 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MFAP2P55001 183 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SETQ01105 290 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SULT2A1Q06520 285 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPA1Q15181 289 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM219BQ5XKK7 198 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OLFM4Q6UX06 510 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR141Q7Z602 305 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TTC39CQ8N584 583 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARRDC1Q8N5I2 433 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MINDY1Q8N5J2 469 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00304Q8N9R0 145 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MDS2Q8NDY4 140 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPAN14Q8NG11 270 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 P2RX5Q93086 422 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNMDQ9H2S6 317 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAI14Q9P0K7 980 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D7Q9P0N9 293 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NSG2Q9Y328 171 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH3GLB1Q9Y371 365 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFNGQ9Y644 331 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACEP12821 1306 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAV18A0A075B6X5 111 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1B0GVC2 190 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP27XA6NNY8 438 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF732B4DXR9 585 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C6orf47O95873 294 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV3-9P01782 118 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYL6BP14649 208 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPORP19235 508 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACP1P24666 158 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ID1P41134 155 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTGDSP41222 190 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLAQ13239 276 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTPRCAPQ14761 206 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00483Q53H64 154 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AMIGO1Q86WK6 493 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF695Q8IW36 515 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CADM2Q8N3J6 435 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL17REQ8NFR9 667 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYDGFQ969H8 173 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBA5Q9GZZ9 404 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR51J1Q9H342 316 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPEP2Q9H4A9 486 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL1RL2Q9HB29 575 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABCD4O14678 606 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGRMC2O15173 223 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLOD3O60568 738 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC2A10O95528 541 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SP9P0CG40 484 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC1A3P43003 542 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FHITP49789 147 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MNAT1P51948 309 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGDIBP52566 201 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STAT2P52630 851 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LIMK1P53667 647 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC17A1Q14916 467 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCLAFQ15004 111 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5orf47Q569G3 176 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1K1Q8NGR3 316 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC22A8Q8TCC7 542 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC26A7Q8TE54 656 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q9H3A6 140 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5orf66Q9H5L9 145 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OLAHQ9NV23 265 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAO2Q9NYQ3 351 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LUZP4Q9P127 313 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRABD2BA6NFA1 517 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTGES3LE9PB15 166 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CT45A10P0DMU9 189 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADRA2CP18825 462 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LONP1P36776 959 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACVR1BP36896 505 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUP107P57740 925 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBXN2AP68543 259 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL10RBQ08334 325 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LCP2Q13094 533 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EMC2Q15006 297 aa0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms